Las instalaciones propias del Centro Universitario de Alajuela, fueron inauguradas el 1 de octubre de1994, gracias al empeño, lucha y perseverancia del Administrador de ese entonces, Lic. Rafael A. Rodríguez F, con el apoyo de un grupo de 180 estudiantes se marchó por las calles alajuelenses, con cartelones solicitando la presencia de la UNED en la Provincia. Es así como, fue posible que con una decisión unánime, se votara a favor de donar un terreno por parte de la Municipalidad de Alajuela a la Universidad Estatal a Distancia. Gracias a esta donación los profesores, administrativos, alumnos y toda la Comunidad Alajuelense disfrutan de su propia casa universitaria.
Desde del 01 de mayo del 2023 la Sede Universitaria de Alajuela, se encuentra a cargo del Lic. Nelson José Briceño Vargas, como administrador de la Sede.
El Centro Universitario ha tenido los siguientes administradores:
- Br. Luis Rodríguez Arguedas
- Licda. María Eugenia Sibaja
- Lic. Marco Vinicio Jiménes Vargas
- Lic. Rafael A. Rodríguez Fallas
- Lic. Jorge Delgado Fernández
- Lic. Lester Osorno Membreño y
- M.Sc. Marvin Calvo Montoya
- Med. Colman Zambrana Ramírez actual administrador.
