El 03 de marzo de 1977, el entonces presidente de Costa Rica, Daniel Oduber Quirós, firmó la Ley No. 6044 "Ley de Creación de la Universidad Estatal a Distancia (UNED), publicada en "La Gaceta" No.50 del 12 de marzo de 1977.

Lo anterior dio paso a la creación de la primera entidad pública de educación superior con modalidad a distancia, y, así, se constituyó en la primera en América Latina; posteriormente, fue declarada como Institución Benemérita de la Educación y la Cultura por la Asamblea Legislativa el día 10 de octubre del 2007.

De dicha Ley, cabe destacar su ARTÍCULO 1°, el cual reza:

"Créase la Universidad Estatal a Distancia (UNED) como una institución de educación superior especializada en enseñanza a través de los medios de comunicación social." (1977:1)

Además, el artículo 16 de dicha Ley establece que la Universidad tendrá un Auditor, quien dependerá directamente de la Junta Universitaria y, para el cargo debe cumplir con los requisitos de ser costarricense y contador público autorizado, con no menos de cinco años de experiencia profesional.

En agosto del año 1978, mediante la aprobación del Plan de Desarrollo de la Universidad Estatal a Distancia, en Sesión No. 95, se aprobaron las funciones para la Auditoría Interna. A continuación, se transcriben:

1. Asesorar al Consejo Universitario, al Rector y al Consejo de Rectoría en todos los asuntos de su competencia.
2. Velar por el cumplimiento del Estatuto Orgánico de la UNED, de los Acuerdos del Consejo Universitario, de los Reglamentos, así como de las Leyes del país en lo que se refiere al buen uso y administración del Patrimonio de la Institución.
3. Analizar, evaluar y controlar el correcto manejo de los procedimientos administrativos y financieros de la UNED.
4. Recomendar y velar por el cumplimiento de los Reglamentos de control interno.
5. Presentar ante el Consejo Universitario un informe Anual de Labores.
6. Ejercer todas las otras funciones que señale el Reglamento de Auditoría, que al efecto apruebe el Consejo Universitario. (1978, punto 1.3.3.2.1)

En los primeros años de la UNED, la labor de Auditoría se ejercía por medio tiempo y consistía en la revisión permanente, sistemática, de los registros contables, presupuestarios y todos aquellos documentos que constituyeran el soporte de las operaciones contables.

En los años 80 el nivel ocupacional de la Auditoría Interna lo conformaba el Auditor Interno, tres inspectores y una secretaria; para el año 1984, se dio un cambio radical en las funciones que ejecutaba la Auditoría Interna, con base en el planteamiento que hizo la Contraloría General de la República y la propuesta emitida por la Comisión de Asuntos Administrativos y Económicos, el Consejo Universitario mediante acuerdo Nº 792, tomado en Acta Nº 505-84 celebrada el 24 de julio de 1984, acordó que se estableciera en la UNED el sistema de auditoría a posteriori (en latín: posterior a); y, por lo tanto, a partir de esa fecha, las funciones que realizaba la Auditoría en forma a priori (en latín: previo a) serían trasladadas a la Administración Activa.

El 30 de octubre de 1986, en Sesión 632, artículo IV, inciso 11), el Consejo Universitario aprobó el primer Reglamento de Auditoría Interna(1) , del cual se transcribe el artículo 3:

La Unidad de Auditoría Interna se regulará de acuerdo con las disposiciones, normas, políticas y procedimientos emitidos o que en el futuro emita la Contraloría General de la República en el ámbito de su competencia y que, de manera general, están contenidos en el "Manual sobre Normas Técnicas de Auditoría para la Contraloría General de la República y las Entidades y Órganos sujetos a su fiscalización", publicado en la Gaceta Nº 104 de 31 de mayo de 1982 y en sus complementos en el "Manual para el Ejercicio de la Auditoría Interna en las Entidades y Órganos sujetos a la fiscalización de la Contraloría General de la República.

A continuación, se citan en su orden, los nombres de funcionarios que desempeñaron el cargo de Auditor, desde la creación de la Auditoría Interna de la UNED:

Enrique Del Barco Silva

Fernando Campos Ramos

Ceferino Rodríguez Zúñiga (Nombramiento interino)

Rulamán Vargas Villalta

Luis Edgardo Ramírez Zamora

Eduardo Castillo Arguedas (Nombramiento interino)

José Enrique Calderón Solano

Mag. Karino Alberto Lizano Arias

También, se transcriben los nombres de algunos funcionarios que prestaron servicio en difernes cargos en la Auditoría Interna:

Rafael Ángel Rodríguez Fallas

Ceferino Rodríguez Zúñiga

Jorge Vargas Bolaños

Yamileth Chacón Fonseca

Pablo Ramírez Mendoza

Eduardo Castillo Arguedas

Ligia Meneses Sanabria

Manuel Sánchez Alonso

Maribel Rivera Villalobos

Celia Corrales Chavarría

Ana Lorena Picado Camacho

Óscar E. Morales González

Manuel Emilio Murillo Alfaro

Yorleny Sánchez Godínez

Marisol Robles Arias

Alfonso Machado Rodríguez

Actualmente, la Auditoría Interna está bajo la dirección del Lic. Héctor Román Saballos Pomares, Auditor Interno, cargo que desempeña a partir de mayo del 2024.

_{(1) Derogado por el "Reglamento de Organización y Funcionamiento de la Auditoría Interna de la Universidad Estatal a Distancia", publicado en el Diario Oficial La Gaceta No. 25 del vienres 03 de febrero del 2012.}